Imprimer Envoyer

La résistance aux antibiotiques et comment la contrôler

La résistance aux antibiotiques constitue un problème important dans la médecine humaine et animale. La compréhension de l'épidémiologie de la résistance aux antibiotiques est extrêmement importante pour pouvoir proposer des mesures permettant d'empêcher sa propagation.


La résistance aux antibiotiques est un sujet de recherche complexe. Il traite de la taxonomie, de l'épidémiologie, de la prise en charge des maladies et de la biologie moléculaire. De plus, il nécessite de grandes connaissances en chimie.


antibiotiques

Du fait de cette complexité, la recherche du service Zoonoses alimentaires et hautement pathogènes et Résistance aux antibiotiques se focalise principalement sur des résistances spécifiques  sélectionnées, c'est-à-dire le staphylocoque doré résistant à la méticilline (MRSA), les entérobactéries résistantes à la céphalosporine et  la salmonelle. Nous accordons pour le moment moins d'attention aux autres bactéries et résistances .

 

Les éléments suivants sont étudiés de manière plus détaillée : les caractéristiques de la résistance phénotypique, l'épidémiologie de la résistance aux antibiotiques, l'origine génétique de la résistance, l'origine génétique des bactéries, la localisation des gènes de résistance et la détermination de la mobilité de l'élément génétique mobile in vitro et in vivo.

Il existe en outre un certain nombre de programmes de surveillance en cours, élaborés pour l'AFSCA. Tous les tests de susceptibilité se font au CERVA. D'une part, la résistance en ce qui concerne Salmonella et Escherichia coli est suivie depuis plusieurs années. Il existe depuis 2011 un nouveau programme qui suit, auprès de différentes espèces animales, la présence de la résistance chez les entérocoques et les E.coli commensaux .


A côté de ces surveillances générales , une surveillance annuelle est organisée en ce qui concerne la prévalence des MRSA. Nous avons entamé en 2010, 2011 et 2012 des surveillances respectivement chez le porc, la volaille ( tant les poules pondeuses que les poulets de chair et les dindes) et les bovins ( laitiers, de viande et les veaux à l'engrais) . Nous avons déjà fait en 2007 et 2009 une étude de prévalence chez les porcs.

La prévalence de la résistance microbienne augmente continuellement. C'est pourquoi les produits antimicrobiens doivent être utilisés le moins souvent possible et de la manière la plus optimale possible. En collaboration avec BAPCOC ( Belgian Antibiotic Policy Coordination Committee) et AMCRA, on travaille à la stimulation d'un usage rationnel des antibiotiques.

Une des méthodes permettant de réduire l'utilisation d'antimicrobiens (et, éventuellement, de réduire la prévalence des bactéries résistantes) est de trouver des alternatives à leur utilisation. Notre laboratoire évalue des méthodes dans le cadre de la MRSA, pour lequel l'utilisation de phages et de lysines des phages est étudiée, ainsi que pour les Escherichia coli pathogènes aviaires, pour lesquelles l'utilisation de phages et les stratégies de désinfection sont étudiées.

En outre, différents suppléments alimentaires, comme des acides, certains composants de plantes... jouent un rôle dans les programmes de lutte. Chez les porcs, on a examiné leur capacité à diminuer la transmission de salmonella. Cet axe de recherche " méthodes alternatives" est en pleine expansion.

Une autre méthode pour analyser l'élimination de bactéries résistantes spécifiques est d'étudier l'interaction de la bactérie avec son hôte. Les données ainsi obtenues peuvent donner lieu à des stratégies d'élimination optimales telles que des modifications au niveau de la prise en charge, des vaccinations, etc.

 

RÔLE DU CODA-CERVA :

Le CODA-CERVA est un centre de recherche très important pour la résistance aux antibiotiques.

 

Ses recherches portent principalement sur l'épidémiologie moléculaire de résistances spécifiques et sur le contrôle de la résistance aux antibiotiques par des moyens alternatifs.

 

Il se penche également sur l'usage des antibiotiques. Les alternatives recherchées sont les suivantes : options de prise en charge, usage de la désinfection, extraits de plantes, substances chimiques comme les acides, probiotiques, inhibiteurs d'efflux et utilisation de bactériophages et de lysines des phages dérivés... La recherche ne se limite pas à une espèce bactérienne en particulier. Cependant, la plupart des recherches ont été réalisées sur la salmonelle, l'E. coli, les mycoplasmes, les entérocoques, les staphylocoques et les streptocoques.

ÉQUIPE SCIENTIFIQUE :

Pierre Wattiau

Vicky Jasson

 

PUBLICATIONS CODA-CERVA :

2011

 

- Smet A, Rasschaert G, Martel A, Persoons D, Dewulf J, Butaye P, Catry B, Haesebrouck F, Herman L, Heyndrickx M. 2011. In situ ESBL conjugation from avian to human Escherichia coli during cefotaxime administration. J Appl Microbiol. 110:541-9.
- Hallin M, De Mendonça R, Denis O, Lefort A, El Garch F, Butaye P, Hermans K, Struelens MJ. Diversity of accessory genome of human and livestock-associated ST398 methicillin resistant Staphylococcus aureus strains. Infect Genet Evol. 2011 Mar;11(2):290-9.

 

2010

-Vanderhaeghen W., T. Cerpentier, C. Adriaensen, J. Vicca, K. Hermans, and P. Butaye. 2010. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) ST398 associated with clinical and subclinical mastitis in Belgian cows. Vet. Microbiol. 144:166-71.

-Vanderhaeghen W., K. Hermans, F. Haesebrouck and P. Butaye. 2010. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in food production animals. Epidemiol. Infect. 138:606-625;

- Persoons D, Dewulf J, Smet A, Herman L, Heyndrickx M, Martel A, Catry B, Butaye P, Haesebrouck F. Prevalence and Persistence of Antimicrobial Resistance in Broiler Indicator Bacteria. Microb Drug Resist., 2010,16(1):67-74.

- Bjørkeng EK, Tessema GT, Lundblad EW, Butaye P, Willems R, Sollid JE, Sundsfjord A, Hegstad K. ccrABEnt serine recombinase genes are widely distributed in the Enterococcus faecium and Enterococcus casseliflavus species groups and are expressed in E. faecium. Microbiology. 2010 Dec;156(Pt 12):3624-34.

- Boyen F, Vangroenweghe F, Butaye P, De Graef E, Castryck F, Heylen P, Vanrobaeys M, Haesebrouck F. Disk prediffusion is a reliable method for testing colistin susceptibility in porcine E. coli strains. Vet Microbiol. 2010, 144(3-4):359-62

- Persoons D, Haesebrouck F, Smet A, Herman L, Heyndrickx M, Martel A, Catry B, Berge AC, Butaye P, Dewulf J. Risk factors for ceftiofur resistance in Escherichia coli from Belgian broilers. Epidemiol Infect. 2010 Jun 29:1-7

- Smet A, Martel A, Persoons D, Dewulf J, Heyndrickx M, Claeys G, Lontie M, Van Meensel B, Herman L, Haesebrouck F, Butaye P. Characterization of Extended-Spectrum beta-Lactamases Produced by Escherichia coli Isolated from Hospitalized and Nonhospitalized Patients: Emergence of CTX-M-15-Producing Strains Causing Urinary Tract Infections. Microb Drug Resist. 2010, 16(2):129-34.

- Smet A, Van Nieuwerburgh F, Vandekerckhove TT, Martel A, Deforce D, Butaye P, Haesebrouck F. Complete nucleotide sequence of CTX-M-15-plasmids from clinical Escherichia coli isolates: insertional events of transposons and insertion sequences. PLoS One. 2010 Jun 18;5(6):e11202.

2009

- Smet A., A.Martel, D. Persoons , J. Dewulf, M. Heyndrickx, A. Cloeckaert, K. Praud, G. Claeys, B. Catry, L. Herman, F. Haesebrouck, and P. Butaye. 2009. Comparative analysis of extended-spectrum-ß-lactamase-carrying plasmids from different members of Enterobacteriaceae isolated from poultry, pigs and humans: evidence for a shared ß-lactam resistance gene pool? J. Antimicrob. Chemother. 63:1286-1288.

- Persoons D., S. Van Hoorebeke, K. Hermans, P. Butaye, A. de Kruif, F. Haesebrouck, and J. Dewulf. 2009. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus in poultry. Emerg Infect Dis. 15:452-453.

- Denis O., C. Suetens, M. Hallin, B. Catry, I. Ramboer, M. Dispas, G. Willems, B. Gordts, P. Butaye, and M.J. Struelens. 2009. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus ST398 in swine farm personnel, Belgium. Emerg. Infect. Dis. 15:1098-1101.

- Rasschaert G., W. Vanderhaeghen, I. Dewaele, N. Janez, X. Huijsdens, P. Butaye, and M. Heyndrickx. 2009. Comparison of fingerprinting methods for typing MRSA ST398. J. Clin. Microbiol. 47:3313-22.

- Persoons D., J. Dewulf, A. Smet A, L. Herman, M. Heyndrickx, A. Martel, B. Catry, P. Butaye, and Haesebrouck F. 2009. Prevalence and Persistence of Antimicrobial Resistance in Broiler Indicator Bacteria. Microb Drug Resist. 16:67-74

- Smet A., A. Martel, D. Persoons, J. Dewulf, M. Heyndrickx, L. Herman, F. Haesebrouck, and P. Butaye. 2009. Broad-spectrum beta-lactamases among Enterobacteriaceae of animal origin: molecular aspects, mobility and impact on public health. FEMS Microbiol Rev. 34:295-316.

- Kiiru J.N., S.M. Saidi, B.M. Goddeeris, N.C. Wamae, P. Butaye, S.M. Kariuki. 2009. Molecular characterisation of Vibrio cholerae O1 strains carrying an SXT/R391-like element from cholera outbreaks in Kenya: 1994-2007. BMC Microbiol. 9:275.

- Huehn S, Helmuth R, Bunge C, Guerra B, Junker E, Davies RH, Wattiau P, van Pelt W, Malorny B. 2009. Characterization of pathogenic and resistant genome repertoire reveals two clonal lines in Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B (+)-tartrate positive. Foodborne Pathog Dis. 6:431-43.

2008

 

 

- Hendriksen R.S., D.J. Mevius, A. Schroeter, C. Teale, E. Jouy, P. Butaye, A. Franco, A. Utinane, A. Amado, M. Moreno, C. Greko, K.D. Stark, C. Berghold, A.L. Myllyniemi, A. Hoszowski, M. Sunde, and F.M. Aarestrup. 2008. Occurrence of antimicrobial resistance among bacterial pathogens and indicator bacteria in pigs in different European countries from year 2002 - 2004; the ARBAO-II study. Acta Vet. Scand. 50:19
- Hendriksen R.S., D.J. Mevius, A. Schroeter, C. Teale, E. Jouy, P. Butaye, A. Franco, A. Utinane, A. Amado, M. Moreno, C. Greko, K.D. Stark, C. Berghold, A.L. Myllyniemi,, D. Wasyl, M. Sunde, and F.M. Aarestrup. 2008. Prevalence of antimicrobial resistance among bacterial pathogens isolated from cattle in different European countries: 2002-2004. Acta Vet. Scand. 50:28
- Hermans, K., Lipinska, U., Denis, O., Deplano, A., Struelens, M.J., Nemati, M.; Pasmans, F., Butaye, P., Martens, A., Deprez, P., Haesebrouck, F. 2008. MRSA clone ST398-SCCmec IV as a cause of infections in an equine clinic. Vlaams Diergeneeskundig Tijdschrift, 77: 429-433.
- Smet A., A. Martel, D. Persoons, J. Dewulf, M. Heyndrickx, B. Catry, L. Herman, F. Haesebrouck, and P. Butaye. 2008. Diversity of extended-spectrum-β-lactamases and class C β-lactamases among cloacal Escherichia coli in Belgian broiler farms. Antimicrob. Agents Chemother., 52:1238-1243.

2007

- Cloeckaert A., K. Praud, B. Doublet, A. Bertini, A. Carattoli, P. Butaye, H. Imberechts, S. Bertrand, J.M. Collard, G. Arlet, F.X. Weill. 2007. Dissemination of an Extended-Spectrum-{beta}-Lactamase blaTEM-52 gene-carrying IncI1 plasmid in various Salmonella enterica Serovars isolated from poultry and humans in Belgium and France, 2001-2005. Antimicrob. Agents Chemother., 5:1872-1875.
- Maes D., J. Vicca, T. Stakenborg, P. Butaye, A. de Kruif, and F. Haesebrouck. 2007. Gevoeligheid van Belgische Mycoplasma hyopneumoniae-isolaten voor antimicrobiele middelen Vlaams Diergen. Tijdschr. 76: 300-305
- Szakonyi G., D. Leng, P. Ma, K.E. Bettaney, M. Saidijam, A. Ward, S. Zibaei, A.T. Gardiner, R.J. Cogdell, P. Butaye, A.B. Kolsto, J. O'reilly, R.J. Hope, N.G. Rutherford, C.J. Hoyle, P.J. Henderson. 2007. A genomic strategy for cloning, expressing and purifying efflux proteins of the major facilitator superfamily. J. Antimicrob. Chemother. 59:1265-1270.
- Vicca J, D. Maes, T. Stakenborg, P. Butaye, F. Minion, J. Peeters, A. de Kruif, A. Decostere, and F. Haesebrouck. 2007. Resistance mechanism against fluoroquinolones in Mycoplasma hyopneumoniae field isolates. Microb. Drug Resist., 13:166-170.

2006
- Arlet G., T.J. Barrett, P. Butaye, A. Cloeckaert, M.R. Mulvey, D.G. White. 2006. Salmonella resistant to extended-spectrum cephalosporins: prevalence, and epidemiology, Microbes Infect. 8:1945-1954.
- Bertrand S., F. X. Weill, A. Cloeckaert, M. Vrints, E. Mairiaux, K. Praud , K. Dierick, C. Wildemauve, C. Godard, P. Butaye, H. Imberechts, P.A.D. Grimont and J.-M. Collard. 2006. Clonal emergence of extended spectrum ß-lactamase-producing (CTX-M-2) Salmonella enterica serovar Virchow isolates with a reduced susceptibility to ciprofloxacin in poultry and humans in Belgium and France, 2000 - 2003. J Clin Microbiol. 44:2897-2903.
- Butaye P., G.B. Michael, S. Schwarz, T.J. Barrett, A. Brisabois, and D.G. White .2006 The clonal spread of multidrug-resistant non-Typhi Salmonella serotypes, Microbes Infect. 8:1891-1897.
- Haesebrouck F., D. Vancraeynest, K. Hermans, B. Catry, P. Butaye, A. Decostere. 2006. Methicilline-resistente stapylococcus aureus stammen bij dieren: een gevaar voor de gezondheid van dier en mens? Vlaams Diergen. Tijdschr., 75, 254-261.
- Michael G.B., P. Butaye, A. Cloeckaert, S. Schwarz. 2006. Genes and mutations conferring antimicrobial resistance in Salmonella: an update. Microbes Infect. 8:1898-1914.
- Saidijam M, G. Benedetti, Q. Ren, Z. Xu, C.J. Hoyle, S.L. Palmer, A. Ward, K.E. Bettaney, G. Szakonyi, J. Meuller, S. Morrison, M.K. Pos, P. Butaye, K. Walravens, K. Langton, R.B. Herbert, R.A. Skurray, I.T. Paulsen, J. O'reilly, N.G. Rutherford, M.H. Brown, R.M. Bill, P.J. Henderson PJ. 2006. Microbial drug efflux proteins of the major facilitator superfamily. Curr. Drug Targets. 7:793-811.

2005
- Boucheron S., C.-H. Chiu, P. Butaye, E. Chaslus-Duncle, and A. Cloeckeart. 2005 High-Level resistance to fluoroquinolones linked to mutations in gyrA, parC, and par in Salmonella enterica serovar Scharzengrund isolates from humans in Taiwan. Antimicrob. Agents Chemother., 49:862-863.
- Butaye, P., L.A., Devriese, and F. Haesebrouck. 2005. Effect of avilamycine fed to chickens on E. faecium counts and on the selection of avilamycin-resistant E. faecium populations. Microbial Drug Resistance, 11:170-177.
- De Leener E., A. Martel, E.M. De Graef, J. Top, P. Butaye, F. Haesebrouck, R. Willems, and A. Decostere. 2005. Molecular analysis of human, porcine and poultry Enterococcus faecium isolates and their erm(B) genes. Appl. Environ. Microbiol. 71:2766-2770.
- Hendricks O., A. Molnar, T.S. Butterworth, P. Butaye, H.J. Kolmos, J.B. Christensen, and J.E. Kristiansen. 2005. In vitro Activity of Phenothiazine Derivatives in Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium. Basic Clin. Pharmacol. Toxicol. 96:33-6.
- Saidijam M., Bettaney KE., SzakonyiG., Psakis G., Shibayama K., Suzuki S., Clough JL., Blessie V., Abu-Bakr A., Baumberg S., Meuller J., Hoyle CK., Palmer SL., Butaye P., Walravens K., Patching SG., O'reilly J., Rutherford NG., Bell RM., Roper DI., Philips-Jones MK., Henderson PJ. 2005. Active membrane transport and receptor proteins from bacteria. Biochem. Soc. Trans., 33:867-72.
- Stakenborg T., J. Vicca, P. Butaye, D. Maes, F. C. Minion, J. Peeters, A. de Kruif, F. Haesebrouck. 2005. Characterization of in vivo acquired resistance of Mycoplasma hyopneumoniae to macrolides and lincosamides. Microbial Drug Resistance, 11:290-294.

2004
- Doublet, B., P. Butaye, H. Imberechts, J.-M. Collard, E. Chaslus-Duncla, and A. Cloeckeart. 2004 First human case of Salmonella enterica serovar Agona harbouring the variant Salmonella genomic island 1-A multidrug resistance gene cluster. Emerg. Infect. Dis., 10:756-758.
- Doublet, B., P. Butaye, H. Imberechts, D. Boyd,M. R. Mulvey, E. Chaslus-Duncla, and A. Cloeckeart. 2004. Salmonella genomic island 1 multidrug resistance gene clusters in Salmonella enterica serovar Agona isolated in Belgium in 1992 to 2002. Antimicrob. Agents Chemother. 48:2510-2517.
- J. Vicca, T. Stakenborg, D. Maes, P. Butaye, J. Peeters, A. de Kruif, F. Haesebrouck. 2004. In vitro susceptibility of Myoplasma hyopneumoniae field isolates. Antimicrob. Agents Chemother.. 48:4470-4472.

2003

- Butaye, P., L.A. Devriese, and F. Haesebrouck. 2003. Antimicrobial growth promoters used in animal feed: a review of the less well known antibiotics and their effects on Gram-positive bacteria. Clin. Microbiol. Rev., 16:175-188.
- Butaye, P, A. Cloeckaert, and S. Schwarz. 2003. Mobile genes coding for efflux-mediated antimicrobial resistance in Gram-positive and Gram-negative bacteria. Int. J. Antimicrob. Agents, 22:205-210.

2002
- Baele, M., L.A. Devriese, P. Butaye, and F. Haesebrouck. 2002. Composition of enterococcal and streptococcal flora from pigeon intestines. J. Appl. Microbiol., 92:348-351.
- Butaye, P., M. Baele, L.A. Devriese, and F. Haesebrouck. 2002. Comparison of Susceptibility to Antimicrobials of the Enterococcal Species isolated from Pigeons (Columba livia). Microb. Drug Resist. 8:215-218.

2001

- Butaye, P., L.A. Devriese, and F. Haesebrouck. 2001 Differences in antibiotic resistance patterns of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium strains isolated from pet and farm animals. Antimicrob. Agents Chemother., 45:1347-1378.
- Butaye, P., L.A. Devriese, and F. Haesebrouck. 2001. Veterinair gebruikte ß-lactam antibiotica: activiteit en resistentie. Vlaams Diergen. Tijdschr., 70:172-179.